MoGAAAP: a modular Snakemake workflow for automated genome assembly and annotation with quality assessment academic.oup.com/nargab/artic... 🧬💻🧪 github.com/dirkjanvw/Mo...
26.01.2026 17:03
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MoGAAAP: a modular Snakemake workflow for automated genome assembly and annotation with quality assessment academic.oup.com/nargab/artic... 🧬💻🧪 github.com/dirkjanvw/Mo...
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Dans le cadre de cette semaine de l'innovation, Lundi 24 après-midi, il y aura une visite de 2 plateformes historiques de l'Université de Bordeaux : Bordeaux Protéome et le CBiB.
www.u-bordeaux.fr/evenements/s...
🎉 Le CBiB est désormais officiellement une Unité de Service de l'Université de Bordeaux (US Ubx 006), suite au vote du CA du 13 novembre. Une étape clé pour renforcer notre visibilité, nos collaborations scientifiques et nos projets nationaux. 🚀
@univbordeaux.bsky.social #CBiB #bioinfo
Proud to have been part of the #EOSC4cancer project with the @univbordeaux.bsky.social and the @cnrsaquitaine.bsky.social (IBGC UMR CNRS 5095) @scienceinnovation.ec.europa.eu
rea.ec.europa.eu/research-and...
Journées IQuaRe du réseau IBiSA. Toujours un plaisir de retrouver les collègues RMQ et d'échanger, partager avec eux.
www.linkedin.com/posts/emmanu...
Et le serpent se mord la queue ! 😱
emploi.developpez.com/actu/375598/...
Les jeunes utilisent ChatGPT pour rédiger leurs CV, les RH utilisent l'IA pour les lire et personne n'est embauché : quand les IA se parlent entre elles et tuent le marché de l'emploi.
Keynote de Björn Grüning à #JOBIM2025 : #Galaxy, plateforme et workflows clés pour une bioinfo ouverte, accessible et reproductible. #GalaxyProject #bioinfo
@ifb-elixir-fr.bsky.social @sfbi.fr @jobim2025.bsky.social
Le jeudi 18 septembre, le Département Sciences Biologiques et Médicales organise une matinée d’échanges et de découvertes au bâtiment BBS.
📖 Pour en savoir plus :
🔗https://sbm.u-bordeaux.fr/actualites/le-salon-des-plateformes-une-matinee-pour-decouvrir-et-echanger
Martin Racoupeau also presented a poster about Pan1c: forge.inrae.fr/genotoul-bio... at #jobim2025.
Yesterday 2 more posters were presented in #jobim2025.
Aldair Martinez presented his poster on the recombination of the avian influenza virus and Christophe Klopp presented the work of Adela Poublan-Couzardot on the assembly of Medicago sativa. We have another poster today number 194 about Snoboard.
✅ Retrouvez également l'interview des deux porteurs de CAP BIOSPACE, les chercheurs Jean-Luc Morel et Jean-François Quignard : www.u-bordeaux.fr/ac...
Le projet CAP BIOSPACE a été officiellement lancé il y a peu dans le cadre du Salon international de l’Aéronautique et de l’Espace afin de structurer une offre de formation interdisciplinaire, du secondaire au doctorat, en biologie & santé spatiale - découvrez le projet : www.u-bordeaux.fr/un...
BEAST X for Bayesian phylogenetic, phylogeographic and phylodynamic inference www.nature.com/articles/s41... 🧬🖥️🧪 github.com/beast-dev/be...
🧬 New R package from our team!
SeuratIntegrate for application&comparison of multiple single-cell integration methods (Seurat, Harmony, LIGER, scVI…)—in Seurat.
Led by Domitille Chalopin, developed by Florian Specque
🔗 bordeaux-bioinformatics.fr/seuratintegr...
#scRNAseq #Bioinformatics #RStats
📻 Pour sa chronique sur @franceinter.fr, Thierry Lhermitte est allé à @incia-neurocampus.bsky.social , où Muriel Thoby-Brisson et Marion Tissier-Raffin unissent leurs expertises en biologie et en droit pour explorer les impacts de l’environnement sur la santé humaine :
www.radiofrance.fr/f...
Laurent Groc presenting at the @academiesciences.bsky.social @iins-bordeaux.bsky.social @neurobordeaux.bsky.social
New preprint from our lab! TrialMatchAI an AI-driven patient-to-trial matching system, with outstanding work by
Majd Abdallah. arxiv.org/abs/2505.085...
It uses fine-tuned LLMs + medical chain-of-thought reasoning.
#LLM #ClinicalTrials #PrecisionMedicine #TrialMatchAI #Bioinformatics
Harvard has set an example for other higher-ed institutions - rejecting an unlawful and ham-handed attempt to stifle academic freedom, while taking steps to make sure students can benefit from an environment of intellectual inquiry, rigorous debate and mutual respect. Let’s hope others follow suit.
Combining DNA and protein alignments to improve genome annotation with LiftOn genome.cshlp.org/content/35/2... 🧬🖥️🧪 github.com/Kuanhao-Chao...
A partir de demain et tout le WE, c’est la collecte des Restos du cœur.
La collecte en 2024 c'est l'équivalent de 9 millions de repas sur les 163 distribués, cela représente donc une part très importantante des ressources de l'association.
Quel plaisir de voir l’Europe 🇪🇺s’envoler à chaque fois ! 🚀Aujourd’hui plus que jamais nous avons besoin d’un accès souverain à l’espace, et de ne pas devoir se reposer sur d’autres puissances spatiales, pas besoin de faire un dessin je pense. #Ariane6 #VA263
Genus-wide plant pangenome could inform next-generation crop design
www.nature.com/articles/d41...
A good candidate for an Ig-Nobel 🏆
Foundation models in bioinformatics https://academic.oup.com/nsr/advance-article/doi/10.1093/nsr/nwaf028/7979309 🧬🖥️🧪
GPTCelltype: Assessing GPT-4 for cell type annotation in single-cell RNA-seq analysis nature.com/articles/s41...
One of the cooler things I saw at the Nextflow summit a few months ago. Can't wait to try this.
What large language models know and what people think they know https://www.nature.com/articles/s42256-024-00976-7 🧬🖥️🧪 https://osf.io/y7pr6/
Je viens de faire mon #eXit! L’exode de X est massif. Ne perdez pas un seul de vos abonnés. Grâce à #HelloQuitX j’ai inscrit 343 nouveaux passagers pour partir vers #BlueSky & #Mastodon. Retrouvez automatiquement vos communautés le #20Janvier via app.helloquitx.com !
